居住在高天原的各个神灵着急的不行，他们聚在一起，想出了一个办法引天照大御神重新普照大地。在山岩屋户门口，神灵们点起篝火竖起神器，围在一起唱歌跳舞，好不愉快。但同时，他们在神木高处安置了巨大的镜子和勾玉，时刻观察着山洞洞口的情况。
听到洞外的欢声笑语，天照大御神偷偷挪开挡住出路的岩石，从一条缝隙中观察外面的情况。此时天照大神的动向被八咫镜映了出来，事先准备在洞外的神灵赶紧使劲，搬开石头把天照大御神拖了出来。
众神恳求天照大御神不要再回到山洞中，天照终于同意，这时世界重新变得明亮起来，重归平稳秩序的生活当中。而罪魁祸首须佐之男命被高天原驱逐，最终到达了出云国。这便是八岐大蛇和天丛云剑故事的开始。
须佐之男命来到出云国，遇到一对老夫妇。夫妇原有八个女儿，前七个都被八岐大蛇吃掉，第八个女儿奇稻田姬也将大祸临头。须佐之男命表示，自己将讨伐八岐大蛇，如若成功，便将奇稻田姬许配给自己。
这段剧情，和《大神》中颇为相似。虽然游戏中的须佐之男命是个有点废的木剑剑士，不过很是喜欢河畔对过，种稻酿酒的奇稻田姬。之后讨伐八岐大蛇的细节，也与神话中极为相似。
须佐之男命设计准备了八个装满烈酒的酒桶，引诱八岐大蛇的头钻进墙中。八岐大蛇果然中计，八个头全部喝醉不省人事。须佐之男命趁机将各个头部逐一斩杀，在割至尾部之时，在八岐大蛇体内发现了一把坚硬锋利的武器：天丛云剑（草薙剑）。
功成身就的须佐之男命与奇稻田姬结婚，并把发现的这把神剑献给了天照大御神。
须佐之男命和奇稻田姬生了很多孩子，后代其中一名叫大国主神的人经历了种种试炼，建立了地上之国。这时，天照大御神说“地上之国本应由天神治理”，便派高天原的建御雷神下凡，与大国主神及其儿子们商谈让位一事。
最终，天照大御神的孙子邇邇芸命来到并接管了地上之国。天孙降临时，邇邇芸命携带了稻穗和三神器八咫镜、八尺琼勾玉、天丛云剑一同下凡，这三神器也因此成为了统治国家的象征。日本神话中第一位天皇神武天皇，便是邇邇芸命的后代，同时也是天照大神后人。天照大神是日本皇室的祖神，国民的总氏神，由此可见她和三神器在历史上的地位究竟有多高。
三神器犹如日本的传国玉玺，不过其存在与否至今是一个谜团。关于三神器还存在的记载，停止于公元690年（《日本书纪》）。《吾妻镜》记载，1185年的战乱期间，安德天皇将天丛云剑和八尺琼勾玉投入了关门海峡，再在鸟羽天皇即位时，三神器下落已不知所踪。之后当权者制作了赝品继续象征正统皇位，结果在战争中又一次被分别抢夺。
目前，三神器的八咫镜据传深藏在供奉天照大神的伊势神宫当中，不过从未公开露面，也从未有人声称自己见到了真正的八咫镜；传说装有八尺琼勾玉的箱子投入海峡后浮出水面，被人打捞，现在存放在皇居的“剑玺之间”，存在与否的消息也只有在昭和天皇丧礼时，接手过箱子的人说“大概能装一个小孩头一样圆的东西”的证言；剑玺之间藏有天丛云剑的替代品，真品已不知所踪。
三上真司、神谷英树、稻叶敦志等一票人从卡普空赶出来，成立四叶草工作室时，《大神》的开发就已经步入了日程。不过当初的设计思路，较成品来看更加偏激：一款完全没有人类出现，在荒野星球上打恐龙的动作冒险游戏。受《生化危机4》的影响，当时游戏并非一上来就用特殊技巧渲染画面，而是尽可能以“真实”为目标制作。
源于天照大神的创意来源，是在游戏开发过程中遭遇挫折之后重新思考的结果。最终在神谷英树的指导下，《大神》才终于敲定了水墨作画的美术风格，成就了一部经典之作。
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