在经过了九九八十一天的剧烈震荡之后，天地终于重开，原有的神州大地已经不复存在，取而代之的是空中一个个漂浮的岛屿。在最大的岛屿上，幸运地存活下了一群人，他们把自己所在的岛屿命名为神州岛，称自己为神州人。
经过这场天地的浩劫，仙界、人界和水族的命运从此改写，各自开始了一段新的历程。
天宫所在的蓬莱岛，因为远离陆地，受到的冲击较小，总算保全了下来，但是参与大战的众仙却伤亡惨重，尤其是八仙中的韩湘子、蓝采和和曹国舅不知所终，生死不明。玉帝王母对于八仙下凡引发的这次浩劫十分震怒，命五仙服下忘生丹，洗清所有记忆，然后剥夺仙籍，贬为凡人。玉帝王母同时下令，严禁天界的神仙日后再下凡到人间。自此，仙界与人界的往来阻隔了五百年。
而那个令吕洞宾一怒之下引发天地浩劫的妙音，在以身祭海之后，被西来的如来佛祖所救，转世为观世音菩萨。因为她前世与吕洞宾的宿缘给天地带来过浩劫，所以，观世音菩萨发下誓愿，从此不再重拾人世间的情爱。
人间在浩劫过后，却比以前更加希望获得神仙的解救，于是神州岛上龙城的历代城主都会派出飞船前往东方，寻找仙人们居住的岛屿。
大地崩裂之后，四海消失，水族在大浩劫中，几乎伤亡殆尽，只剩下残余的虾兵蟹将，在蓬莱岛的一片水境中存活下来。
就这样过了五百年，天地似乎重归了平静。但是，无论是人、还是仙，似乎都遗忘了一个人－－龙女。当年，在大地崩裂的那一刻，绝望的龙女面对着水族的灭亡，用自己冲天的仇恨发下了一个诅咒－－让天上人间永世得不到安宁，直至下一劫时天毁地灭，龙女用这个诅咒召唤出了水族最强大的水魔，然后将自己的精气与水魔合为一体，化成一颗水魔珠。五百年后，水魔珠将释放出毁天灭地的力量，将仙界和人间重新吞噬。
