扫描系统:
锁定、抓取以及指令输入等扫描动作是专门针对本作的独特操作方式而设置的全新系统。
在进入战斗后,玩家需要通过保持按住Z键用屏幕中心的瞄准具锁定敌人,此时萨姆斯的视点将保持跟随当前锁定目标的状态,以便玩家进行瞄准射击。需要注意的是,在本作中发射导弹需要配合锁定功能使用,在锁定目标状态下,发射出去的导弹可以自动追踪目标,否则只能进行直线攻击,命中精度大幅度下降。
当需要抓取的物体时,只要保持按住Z键状态,萨姆斯就会释放左手的磁力进行远距离抓取。游戏中经常需要使用抓取动作来进行荡秋千式的摆渡或者拉扯掉附着在隐藏路径上的障碍物,可以抓取的物体通常会闪烁微弱的黄色光芒。
游戏中的某些特定环节需要输入指令,在输入指令之前,首先要将目镜模式切换到指令模式,此时屏幕会变为绿色,调整视点将出现在屏幕中的指令符号移动到中央位置,然后保持按住Z键就可以进行指令的输入。
此外,在游戏会有许多闸门的开启装置需要通过扫描来打开操作界面,通常情况下都需要在默认的战斗目镜模式中按下-键对准设备操纵台进行扫描。
升级系统:
同以往作品一样,萨姆斯可以在游戏中进行各项能力的升级,随着游戏的不断深入,玩家不仅可以通过获得道具来提升体力、变形球炸弹以及导弹携带量的上限,还可以令武器进一步强化。游戏中的一些特殊机关需要用经过专门升级后的武器才能打开。不仅如此,以往作品中仅仅作为交通工具的飞船也可以在本作中派上大用处,某些特定的机关和障碍物必须要通过召唤飞船实施轰炸才能通过。
超能模式:
超能模式是在游戏第二章结尾处换装PED战斗服后获得的特殊能力,需要长按-键来进入和退出。进入超能模式后,无论是普通攻击还是蓄力攻击都将有大幅度强化,是对付高等级敌人的不二选择。但是,萨姆斯在超能模式中射击所需要的能力是与等价的体力消耗作为交换的。在超能模式中,屏幕上方将会有一条表示能量剩余量的计量槽,当计量槽中的能量变为零后就会自动退出超能模式。此外,萨姆斯在进入超能模式后以及受到敌人的特殊攻击后极易进入失控状态,具体表现为计量槽不断增长,必须通过不断射击消耗能量来自救。当能量消耗完毕后就会自动解除失控模式,如果能量槽保持蓄积满的状态超过一定时间,萨姆斯就会堕落为黑暗萨姆斯,游戏也自此结束