两款游戏的开发和销售全部结束后进行清算，“心跳回忆基金”在2003年2月时开始分红给投资人。根据游戏销售情况，每股偿还投资人10088日元，收益仅为0.88%。在运营基金当初，KONAMI为了合理避税不仅把交易所放在百慕大群岛，还特意在开曼群岛设立公司进行操作。但因此产生了3.15%的交易手续费，交易10000日元所需的实际金额实为10315日元，按照交易门槛10股计算，需要承担手续费的投资人10万日元付出不仅没有得到任何收益，反而损失了2270日元。实际上，如果不是《心跳回忆女生版》的销量超出预期，仅凭《心跳回忆3》表现的话，投资人甚至连纸面上的那88日元盈利都看不到。

《心跳回忆》未来的主打产品变成了女性向游戏

　　《心跳回忆3》和“心跳回忆基金”的双重失败，不仅使KONAMI自己亲手砍掉了衍生产品的发售计划，还成了玩家和业界的笑柄。《旋风管家》正式连载前的同名短篇漫画在日本漫画杂志周刊少年SUNDAY刊登时，因为一句讽刺“心跳回忆基金”的台词被无比重视“心跳回忆”品牌形象的KONAMI严重抗议，杂志社被迫刊文致歉。作为当事人，以久米田康治助手身份出道的漫画家畑健二郎当时感慨“我的漫画家人生还没开始就结束了”。好在之后《旋风管家》还是成功连载，最后在KONAMI的同意下，修改了台词后的同名短篇才被收录。

　　除了继承优化版EVS系统以外，《心跳回忆3》和之前两作几乎毫无关联。游戏的舞台和角色均为全新设定，这些改革可能是制作组希望能够让这它摆脱前作光环，但因为产品的没能获得用户的青睐，反而让KONAMI方便把这作划入不愿提及的黑历史之中。

　　《心跳回忆3》的滑铁卢让KONAMI承受了巨大的损失，这次崭新的尝试没能收回先期投入，也把辛苦建立的恋爱偶像品牌毁于一旦。《心跳回忆3》之后，这一品牌的正统续作陷入了长达9年的沉默期。而《心跳回忆女生版》出人意料的成功，也让KONAMI把恋爱模拟类游戏的投入转向了女性向市场，连年推出了4款美少年版的《心跳回忆》。

　　为了解决眼前的存续危机，KONAMI让《心跳回忆》站出来成为网游。自2005年下半年，《心跳回忆ONLINE》开始在小范围内接受玩家的体验测试。《心跳回忆ONLINE》被分为了“大型多人在线游戏MMO（Massively Multiplayer Online）”，可以视为《心跳回忆2》中“响野网”的续作；游戏中可攻略的恋爱目标有男有女（但是数量极少），同时兼顾了《心跳回忆》和“女生版”两种不同的用户。最重要的是，这是一款“没有战斗和杀戮的网游”。

《心跳回忆OL》

　　然而在第一次β测试时，玩家就发现KONAMI的“版权综合征”变得越来越严重了。不仅游戏内的关键字和谐一度影响了玩家正常对话，KONAMI对玩家行为的审查甚至延伸到了游戏以外：

　　游戏截图只被允许上传到官方粉丝站；

　　官方网站“不允许出现《心跳回忆OL》以外的任何话题”，包括KONAMI的其他游戏和《心跳回忆》系列游戏；

　　新闻和情报类网站必须申请，经过KONAMI审批同意后，才能更新《心跳回忆OL》相关内容；

　　KONAMI会定期巡视博客等其他社交网站，一旦发现玩家发布负面内容会向社交网站方提出封号，同时封禁游戏账号。

　　在这一阶段，KONAMI刚刚赢得了“心跳回忆事件”的诉讼。对保护著作权做出的极端高压审查，让玩家有一种 “给你游戏玩，然后闭嘴”的负面感受。这种严格的审查还对游戏的宣传起到了负面影响，反而让《心跳回忆OL》的玩家群变得越来越窄，很难按照预期扩展出更加广泛的受众。

　　随着β2测的展开，《心跳回忆OL》的其他问题也变得越发凸显。《心跳回忆OL》是一款让玩家“交朋友、谈恋爱、享受学校生活”的异端网游，和其他MMORPG完全不同。玩家在游戏中除了“剧情事件”、“和NPC谈恋爱”这些线性内容，只有“学习（答题游戏）”、“社团活动（PVP）”、“社团（公会）”和“小游戏（末期实装）”。对于玩家来说，这款网游中可以玩的东西，实在是太少了。

《心跳回忆OL》的诟病是缺乏游戏乐趣

　　然而即使可玩性不佳，KONAMI还是在2006年初正式运营。游戏采用了计时收费制度，包月1200日元，这是同期市面上其他MMORPG的平均收费水准。但相对贫弱的游戏内容使得游戏变成了“大型付费网络聊天室”。