《生化危机》全系列剧情历史事件一览

安布雷拉则开始对国民警卫队与州政府施压反对军方进城。同时通告国民警卫队，现在浣熊市已经爆发大规模疫情，让他们封锁城市周边，但是千万不要进城。由我们来负责。导致军方无法进城支援。同时安布雷拉公司准备毁灭一切证据。

1998年9月25日，全城生化灾难全面爆发，病毒泄漏事件已经无法控制，当晚“每日浣熊”“浣熊时报”职责浣熊市警方封锁的消息。在得到市场办公室的授权后 当日警方公开声称这是一起病毒感染事件

媒体开始指责之前浣熊市警察局瞒报事件真相。（并不是指洋馆，只是指之前在22日、23日时候还是称这是暴力事件）

此时病毒感染人数已经超过十万。警方已经无力控制局面。各大交通要道被堵塞或者破坏导致城市逐渐被孤立。

此时的市长办公室内，市长迈克·沃伦和浣熊市内主要行政要员正通过电话向白宫报道浣熊市内所经历的一切，与保护伞公司有着密切联系的迈克·沃伦已经意识到发生了什么，但是他也清楚自己现在的一切都来自背后的金主保护伞公司。

白宫在接到浣熊市的汇报后，迅速开始安排拯救浣熊市的行动，国民警卫队已经待命相关计划已经开始评估实施。

在绝大多数的市民还不知道浣熊市发生了什么的时候，安妮特·柏金已经预料到这场灾难的结果。在她得知丈夫变异之后，她就知道这场危机会在短时间内让浣熊市崩溃。她把女儿安置在浣熊市警察局内，在叮嘱女儿不要乱跑之后，她离开警察局去找丈夫，她依旧坚信，通过自己的努力能够将丈夫恢复原样。

1998年10月1日，被污染地区包围而四面楚歌的浣熊市已无任何挽救的希望，病毒借助下水管道感染了其中的生物并借此进入城市。灾变很快以污染源所在的城区为中心向全城蔓延。市内紧急部署的军力在很短的时间内就逐渐瓦解。浣熊市渐渐沦为一座被病毒完全侵蚀的人间地狱。美国军方很快封锁了该片区域并投入大规模的军队控制事态进一步恶化。

国家高层紧急通过了“灭菌”作战方案，美国政府为了杜绝所有的后患，将以核弹对浣熊市进行彻底消毒。

首先由美国空军两架F 16战斗机携带钻地型高温燃烧弹，对位于市中心的安布雷拉地下研究所，污水处理厂等重点目标进行精确打击，以确保其地下设施完全消毒。随后发射16枚导弹炸毁外围地区确保无人逃走。然后军方发射一枚战术核弹，将整个浣熊市地表全部摧毁。

还计划执行完成后，建立浣熊市外围的封锁线，并且定期由空军战斗机携带生物监测设备监控对废墟进行巡逻。

任务结果，浣熊市被摧毁1年后，空军仍在废墟下检测到了生物迹象。

总之，整个浣熊市事件，美军的行动几乎全部失败。只有第二阶段时一支侦察小分队完成了任务。另外的收获是成功找到了李昂等人等人，并且拿到了T 病毒疫苗的配方。

卡洛斯找到吉尔告诉她军方将在明天炸毁这个城市。在废品处理厂，吉尔又一次打倒了追踪者。在控制室里，吉尔又干掉了尼古拉。将他扔在了浣熊市等死。在控制室的地面打开了一条逃生通道，追踪者从通风口里又拦住吉尔，而且变成了个爬行动物，吉尔利用离子炮将它完全轰碎。外边，巴瑞开着直生飞机在等着他们，吉尔和卡洛斯上了飞机，一枚导弹从身旁掠过，接着背后是浣熊市被炸后的一片火海数小时后，军方投放了一枚核弹，浣熊市于凌晨从地球上彻底抹去，超过10万人在此次灾变中死亡。史称浣熊市生化危机事件。

原先已确认死亡的艾达，在投靠至H.C.F.的前任S.T.A.R.S.队长威斯克的救助下复活，威斯克从威廉身上得到“G病毒”，艾达在暗中给予里昂和克莱尔协助之后，与威斯克一起逃出浣熊市。整个事件公开后，美国政府颁布了一条法令，无限期禁止安布雷拉的一切商业活动，导致安布雷拉最终破产。

1998年10月上旬在欧洲传来了有人见到艾达的消息，但随后目击证人去向不明。

1998年10月中旬美国中央情报局和里昂取得联系，以雪莉与里昂的性命作要胁，迫使里昂接受了情报局所交付的秘密任务。里昂暂时待在CIA工作并进行调查，但是CIA是否有其它目的并不明朗。1998年11月初接受好友里昂的委托，亚克潜入安布雷拉席那岛监狱进行调查。 此后不久里昂参加了特种部队的训练。

1998年10月9日席那岛监狱的年轻囚犯计划集体越狱。

1998年10月10日席那岛监狱发生囚犯企图夺枪集体越狱事件，席那岛司令官宾赛德下令将逃犯全数射杀。

1998年10月11日宾赛德命令席那岛监狱长，将囚犯就地全数处决，以“集体自杀”的方式向保护伞公司高层汇报。

1998年11月22日 宾赛德将“T病毒”散播到席那岛的街道上，并且伪装成发生意外事故。

1998年11月23日席那岛全岛已经笼罩在“T病毒”所引起的生化危机之下。

1998年11月24日亚克企图从席那岛逃离时，搭乘的直升机被安布雷拉职员击落，因为强烈冲击而丧失记忆。在寻找恢复记忆的线索与逃生方法时，遇到席那岛上的生化灾害幸存者--年仅十二岁的少年洛特·克莱恩(Lott·klein)与洛特的妹妹--莉莉·克莱恩(L.ily klein)

1998年11月25日宾赛德唤醒“超级暴君”企图将亚克灭口，却反被“超级暴君”所杀。亚克成功地将“超级暴君”打倒，带着洛特与莉莉从席那岛逃出，席那岛上的研究设施也因为宾赛德启动自爆装置而全数毁灭。事件后里昂加入反保护伞公司地下组织，不久便前往欧洲进行独立调查，吉尔和克莱尔也各自前往欧洲寻找克里斯。雪莉原为政府有关机构收养，下落不明。

1998年12月12日为了寻找克里斯而侵入安布雷拉巴黎研究所的克莱尔遭到逮捕并送往位于南太平洋的洛克福特岛（Rockfort island ）军事训练所监禁

1998年12月22日克莱尔被移送洛克福岛监狱。

12月27日，谜之组织H.C.F得知阿莱克茜亚·亚希福特和维罗尼卡病毒出现在洛克福德岛，命令阿尔伯特·威斯克率领特殊部队前往夺取。威斯克在轰炸过程中造成病毒泄漏。克莱尔借机逃出监狱，并与年轻犯人斯蒂夫（Steve）相遇。阿尔弗雷德·亚希福特与其发生激战并激活了洛克福德岛的自毁系统。克莱尔和斯蒂夫搭乘飞机逃离里洛克福德岛，然而阿尔弗雷德操纵飞机飞往南极基地。两人在南极基地射伤了阿尔弗雷德，垂死之际，阿尔弗雷德唤醒了沉睡的阿莱克茜亚后死亡。克里斯收到里昂的信息后为救克莱尔也前往洛克福德岛，却遇到了本以为早已死亡的威斯克。威斯克找到阿莱克茜亚并向她讨要维罗尼卡病毒。阿莱克茜亚和威斯克一交手便打跑了威斯克。克里斯和克莱尔即将逃离南极基地之际阿莱克茜亚追至，通过一番艰难的对决，克里斯最终借助这一区域的高能武器消灭了阿莱克茜亚并引爆了南极基地。威斯克则在此之前回收了斯蒂夫身上感染的维罗尼卡病毒。

（于2012年发行的TPS游戏《生化危机：浣熊市行动》揭示了一系列浣熊市背后的剧情，不过和正统剧情有一定冲突，可视为平行世界剧情参考。）

在1998年浣熊市生化危机爆发后，实际上有两支部队被派去击败守在浣熊市底下研究所的雇佣兵，并回收威廉博士持有的G病毒，分别是由汉克带领的U.S.S（安布雷拉秘密工作部队）Alpha小队和“狼母LUPO”带领的Bravo小队，在G病毒回收期间Alpha小队除队长汉克外全数阵亡，并导致威廉博士变异与病毒散入浣熊市下水道（生化危机2），而Bravo小队则在逃脱变异威廉博士的追杀后来到浣熊市市区，并且接到新任务——杀掉里昂.S.肯尼迪，期间遇到以Echo Six为首的美军特种部队，并在市政府，警察局等地与其激战（一定程度上接上了生化危机3和爆发的剧情），在与“复仇女神”等变异体激战后，USS部队得知里昂躲了起来，并被美军保护着，而且得知浣熊市即将被摧毁，USS小队要想撤退就必须杀掉里昂，于是USS部队内部起了矛盾，一方主张放走里昂，一方主张杀掉（由玩家选择），之后的剧情由玩家脑补。

之后添加了美军特种部队Echo six的剧情，是与USS部队反向的，回声小队的任务是找到藏于地下的安布雷拉设施，摧毁它，并且调查病毒事件的真相，不过期间遇到吉尔，而最后的决战则是无选择的与威廉博士对弈，里昂与克莱尔乘坐美军的直升机逃脱。

1998年12月27日，谜之组织H.C.F得知阿莱克西亚（Alexia）与“T-Veronica”病毒出现在洛克福岛，派遣威斯克率领特种部队轰炸该岛，以夺取“T-Veronica”。特种部队轰炸过程中病毒泄漏，造成‘洛克福岛生化危机事件"。克莱尔借机逃出监狱，并与年轻犯人史蒂夫（Steve）相遇。史蒂夫是一个不太相信人，更不愿与人合作的人，即使救了他，他也显得很冷淡，仍然一个人行动。在大厅里，亚力山大·亚希福特之子阿尔弗雷德·亚希福特扮成妹妹阿莱西克亚·亚希福特的模样开枪射击克莱尔，阿尔弗雷德误以为克莱尔是袭击他的基地的人。在另一个地方，史蒂夫突然出现投桃报李，救了克莱尔一回，还和克莱尔开着玩笑，现出他可爱的一面。史蒂夫更为救克莱尔忍痛杀死了因感染病毒而变成丧尸的父亲。克莱尔由此得知，史蒂夫之父原来是一位保护伞公司的小职员，因泄露公司机密而全家被捕，母亲也被当场杀死。在大堂里，克莱尔听见阿莱克西亚（Alexia）和哥哥在谈话，其实这是典型的阿尔弗雷德人格分裂，一个人假扮两个人。阿尔弗雷德的寝室里，阿尔弗雷得又扮成妹妹阿莱克西亚（Alexia）的模样向克莱尔开枪，这时又是史蒂夫突然出现解了围。而且还查出这是阿尔弗雷德的双重人格在做怪。阿尔弗雷得气急败坏，启动自爆装置，要炸掉基地。同时，他放出汉克早先运送过来的“Tyrant”，去杀死克莱尔和史蒂夫。克莱尔和史蒂夫乘坐水上飞机离开洛克福岛，却被随后驾驶鹞式战斗机离岛的阿尔弗雷得遥控操纵水上飞机飞向南极。此时Tyrant出现在飞机货舱内。克莱尔将Tyrant打下飞机，却因为无法改变航向而与史蒂夫双双来到南极。这里正是亚力山大·亚希福特1970年建造的南极研究所。随后，史蒂夫打伤了阿尔弗雷德，阿尔弗雷德离死也不远了。克莱尔和史蒂夫试图坐雪车逃走，却看见一个紫色的背后长着触手的可怕的怪物，这个怪物就是阿尔弗雷德和阿克莱西亚（Alexia）的父亲亚历山大。阿尔弗雷德唤醒了在容器里沉睡的妹妹阿莱克西亚（Alexia），随后也死去了。克莱尔和史蒂夫消灭了亚历山大后，在坐货车时，被一只大触手掀翻，失去知觉。在收到了里昂的通知后，克里斯则为了救出克莱尔，也前往洛克福特岛。威斯克正在寻找阿莱克西亚（Alexia）与“T-Veronica”，正碰见克里斯，克里斯惊异于威斯克的复生，也发现他有了超越人的力量和速度。威斯克正要报仇，在监视器里看到阿莱克西亚（Alexia）的讲话，丢下克里斯便去找她了。克里斯也跟着来到南极，救了克莱尔。克莱尔得救后去寻找史蒂夫，却想不到史蒂夫被注射了病毒，他变成了怪物，疯狂的攻击克莱尔，在关键时刻，凭着对克莱尔的爱，使自己恢复了理智，变回原形，死在克莱尔的怀里。威斯克找到阿莱克西亚（Alexia），要她交出她体内的“T病毒”，阿莱克西亚（Alexia）冷笑着，变成个美貌与力量并存的人，只一手，就能把威斯克打败。威斯克见无取胜的机会，逃跑了，阿莱克西亚（Alexia）接着要取克里斯的性命，但没能成功。克里斯和克莱尔逃到出口处，正要离开，阿莱克西亚（Alexia）又拦住去路，这回变成个丑陋的飞行怪物，克里斯用线性炮将她消灭。克里斯引爆了南极研究所，兄妹俩驾机离开，威斯克则带走了感染“T-Veronica”病毒的史帝夫的遗体。以H.C.F的实力，让死人复活应该不是问题。保护伞公司在世界各地的分支机构。可以确认的有，浣熊市分部（已毁），法国巴黎分部，欧洲席那岛分部，南美洲洛克福特岛分部。

1999年里昂的朋友收到了里昂的委托，孤身前往安布雷拉公司的希纳岛进行侦察。

故事发生在一个名为“希纳岛”的地方，里昂·S·肯尼迪的好友亚克接受其委托，前往调查安布雷拉公司坐落在那里的实验基地。最后成功摧毁了岛上的暴君生产工厂。

2002年，和里昂一起接受特工训练的战友杰克·克劳撒（Jack·Krauser）在一次直升机事故中遇害身亡。实际上他借此机会投靠了阿尔伯特·威斯克。此时，世界三大巨头的公司合并，由迷之组织引导，成为三联公司。它涉及到生物医药、矿产开发、工业兵器生产三个领域。阿尔伯特·威斯克加入三联公司。安布雷拉在超深海层发现了一种狩猎采集型的新品种深海鱼。从那种鱼中，发现了鱼类病源病毒「深渊（The Abyss）」。并且和T-病毒融合，开发了具有威胁性的海洋性病毒兵器「T-深渊」。

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