海王领导的亚特兰蒂斯曾经反抗过超人，但很快就遭到了报应——超人联合几个超级英雄把整个亚特兰蒂斯从海底抬起，直接扔到了撒哈拉沙漠深处。为了保护自己的人民，见识到超人强大力量的海王只能投降认输。
随着事态的不断升级，超人变得越来越偏执和独裁起来。而神奇女侠为了替代露易丝在超人心中的位置，不惜几近丧失理智地支持超人来博得他的欢心，也让超人在黑化的道路上越行越远。
至于其他的超级英雄，要么因为崇拜超人的声望和能力加入他的麾下，要么因为理念不合与他分道扬镳，甚至因此招致灭亡。夜翼迪克•格雷森被叛逃到超人手下的罗宾达米安•韦恩失手杀死、火星猎人因为阻止神奇女侠而被超人活活烧成灰、沙赞原先追随超人，但在看清超人本质之后与他理论，结果直接被热射线射爆……
蝙蝠侠则被超人一众公布了他的真实身份，无法回到蝙蝠洞，只能躲藏在外面伺机行事。他虽然召集了许多英雄和反英雄组成了不义联盟，但还是身单力薄，无法与超人的党派相抗争。他下定决心要用私藏的氪石枪去解决超人，但是这把不到最后时刻不会使用的枪藏在蝙蝠洞里，需要超人身边最亲近的几个英雄的DNA才能解锁——而他们要么跟随了超人，要么已经死亡。
为了能把枪拿出来，蝙蝠侠想到了一个点子，而这也是《不义联盟》初代游戏的开始。
大家都知道美漫有一个传统，画着画着连载不下去了，就重启一下宇宙，另起炉灶重新开始：名字还都是那些名字，但人物的设定、CP、以及世界观，都会有相应的差别，这也就是所谓多元宇宙的设计。
而在《不义联盟》里，蝙蝠侠已经意识到了多元宇宙的存在，于是想办法连接上了最为读者所熟知的那个主世界，把那个世界里的英雄给传送了过来。
有趣的是，主世界里的正义联盟那时正在围捕准备用核弹把大都会炸上天的小丑——只不过主世界里的小丑并没有去打露易丝•莱恩的主意，而我们的超人也完全没有黑化。
就在他们准备夺下小丑手上的引爆器时，蝙蝠侠把他们传送了过来，只有超人、钢骨和闪电侠留在了原来的世界。
而来到不义世界的主世界英雄们逐渐了解到发生了什么，准备帮助不义联盟推翻超人的集权统治。他们救出了被超人抓获的主世界蝙蝠侠，回到蝙蝠洞，用他们的掌纹拿到了氪石枪，但却发现这把枪已经损坏。而气急败坏的超人此时宣布要毁掉大都会和哥谭来消灭这些英雄，并在这一切结束之后入侵主世界，把那个世界的露易丝带回来。
事态紧急，主世界的蝙蝠侠决定把他们没有变坏的超人带到不义的世界。不义蝙蝠侠此时早已不相信超人，但寡不敌众，只能同意主世界英雄们的做法。
主世界超人降临之后势如破竹连战连捷，击败了好几个强敌，并最终得以和不义超对峙。不义超很愤怒，质问他为什么要阻止自己，他分明可以把真正的和平带给全世界，不让曾经的惨案再一次发生；而主世界的超人则怒斥：“难道这就是露易丝真正想要看到的世界吗？”
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